工程建设重大安全事故发生后的处理程序具体如下：
1、接到事故报告后，立即组成事故现场处理小组（2人以上），及时赶到事故现场，并要求事故单位通知市建规委、市安监局、市总工会等部门；
2、事故现场处理：
（1）开展事故现场勘察工作：
现场物证、证人材料或其他事实材料等的搜集；
对现场进行拍照、摄影取证；
进行事故临时问话笔录。
（2）事故现场处理事项：
向事故单位发出停工整改通知单，责令施工现场停工整改或局部停工整改；
责成事故单位必须在24小时内向市建规委、市安监局、市总工会、市建管处等单位提交事故快报表；
责成事故单位立即组成事故调查小组，按要求开展事故现场勘察工作；同时成立事故善后处理小组，作好家属接待、安抚和稳定工作；及时完成理赔工作，并办理相应的签字手续：
由我站对所有相关资料，特别是安全资料进行封存检查；
责成事故单位组织相关当事人（如：业主、监理、项目经理、安全管理员、施工员、事故现场见证人等）配合有关部门进行调查问话；
责成事故单位对项目所有劳务人员重新进行全面的安全教育。
（3）由市建规委、安全监督站及时完成对相关当事人的调查问话，作好问话笔录。
3、责成事故单位于15日内提交事故初步调查报告；
4、配合市建规委、市安监局、市总工会等部门在一个月内，完成事故的调查处理工作。最后通过调查之后对发生建筑工程安全事故的主要负责人做出相应的处罚。
法律依据：《中华人民共和国建筑法》第四十四条
建筑施工企业必须依法加强对建筑安全生产的管理，执行安全生产责任制度，采取有效措施，防止伤亡和其他安全生产事故的发生。
建筑施工企业的法定代表人对本企业的安全生产负责。